MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-8

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017236	TTA	2	6	74	79	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017236	A	6	6	108	113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017236	A	6	6	150	155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017236	A	6	6	168	173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017236	GATT	2	8	183	190	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017236	AT	3	6	201	206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017236	T	6	6	206	211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017236	GAT	2	6	212	217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017236	CTC	2	6	230	235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017236	AAT	2	6	281	286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017236	T	7	7	309	315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017236	CAATC	2	10	320	329	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017236	ATT	2	6	368	373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017236	ATT	2	6	380	385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017236	AAAAAT	2	12	416	427	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017236	A	6	6	449	454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017236	ATT	2	6	5058	5063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017236	TA	3	6	5077	5082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017236	T	7	7	5083	5089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017236	TTTA	2	8	5093	5100	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017236	ATAAAA	2	12	5109	5120	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017236	TAT	2	6	5135	5140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017236	A	8	8	5152	5159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017236	CCT	2	6	5205	5210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017236	TTA	2	6	5211	5216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017236	ACC	2	6	6377	6382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017236	TTC	2	6	6383	6388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017236	T	6	6	6393	6398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017236	TTC	2	6	6400	6405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017236	ACT	2	6	9284	9289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017236	AT	3	6	9297	9302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017236	TAA	2	6	9314	9319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017236	ACT	2	6	9324	9329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017236	ATC	2	6	9351	9356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017236	A	7	7	9386	9392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017236	CTTAA	2	10	10095	10104	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017236	A	6	6	10909	10914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017236	ACC	2	6	11733	11738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017236	AATA	2	8	11758	11765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017236	A	7	7	11787	11793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017236	ATT	2	6	11798	11803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017236	TAA	2	6	11805	11810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017236	TAA	2	6	11815	11820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017236	TA	3	6	11842	11847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017236	A	6	6	11850	11855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017236	T	6	6	11891	11896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017236	TA	4	8	11910	11917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017236	ATT	2	6	12771	12776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017236	AATTAA	2	12	12782	12793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017236	TA	4	8	12794	12801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017236	A	7	7	12840	12846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017236	TAA	2	6	12884	12889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017236	AAT	2	6	12896	12901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017236	ATT	3	9	12905	12913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017236	TAA	2	6	12914	12919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017236	TTAA	2	8	12935	12942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017236	TTAA	2	8	12964	12971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017236	CAA	2	6	13067	13072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017236	TA	3	6	13074	13079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017236	GTTTA	2	10	13677	13686	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017236	AATT	2	8	16191	16198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017236	ATAA	2	8	16227	16234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017236	AAT	2	6	16328	16333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017236	CCT	2	6	16334	16339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017236	C	6	6	16367	16372	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66	NC_017236	GCA	2	6	16387	16392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017236	CAG	2	6	20660	20665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017236	CAA	2	6	20669	20674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.